Vanaf 1 januari 2012 is GOVCERT.NL opgegaan in het Nationaal Cyber Security Centrum (NCSC). Het NCSC draagt bij aan het vergroten van de weerbaarheid van de Nederlandse digitale samenleving. Het is een samenwerkingsplatform van bedrijfsleven, overheid en wetenschap met als kerntaken: expertise en advies, response op dreigingen en incidenten en versterking van de crisisbeheersing.
Het centrum ondersteunt de Rijksoverheid en organisaties in vitale sectoren en werkt aan bewustwording en preventie voor burgers, bedrijven en overheidsorganisaties.